Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к ранней диагностике атеросклероза. Сущность: отбирают у пациента пробу буккального эпителия и осуществляют выделение из указанной пробы дезоксирибонуклеиновой кислоты ДНК. На детектирующем амплификаторе с использованием полимеразной цепной реакции проводят генотипирование полиморфизма генов FAS и ММР9, используя в качестве праймера участок ДНК путем исследования генотипов гена FAS (rs1159120) и гена ММР9 (rs17576). В пробе крови определяют содержание триглицеридов. И при одновременном выполнении следующих условий: наличии комбинации СС генотипа гена FAS (rs1159120), а также генотипа АА гена ММР9 (rs17576), при одновременном превышении уровня триглицеридов в крови выше верхней границы физиологической нормы в 1,15-2,15 раза, оценивают риск развития атеросклероза у мужчин среднего возраста как высокий. Изобретение позволяет обеспечить достоверность диагностики прогнозирования риска развития атеросклероза у мужчин среднего возраста (36-45 лет). 1 табл., 2 пр.