Прогноз вероятных негативных эффектов при комбинированном воздействии химических веществ на основе протеомно-биоинформационного анализа
Вы здесь
Исследование механизмов внешнесредового воздействия химических веществ на организм человека с помощью протеомного профилирования и биоинформационного анализа, позволяет прогнозировать развитие негативных эффектов на самой ранней стадии их формирования. С целью прогнозирования вероятных негативных эффектов при комбинированном воздействии химических веществ на основе протеомно-биоинформационного анализа (на примере оксидов меди и хрома) проведено исследование с помощью методов химико-аналитического, статистического, протеомного и биоинформационного анализа. Установлена трансформация протеомного профиля плазмы крови в натурных и экспериментальных условиях при экспозиции оксидами меди и хрома. Сопоставительный анализ полученных данных показал, что выявлены изменения экспрессии линкерного белка 4, содержащего домен CAP-Gly; белка область C каппа-цепи Ig, аллель А и сидерофлексина-3. На основе проведенного биоинформационного анализа прогнозируются негативные эффекты, связанные с развитием когнитивных нарушений и диффузными изменениями печени.
Комментарии - 4
Уважаемая Екатерина Владимировна, благодарю Вас за интересную статью, при прочтении которой возникли вопросы:
1. В таблице 2 для сидерофлексина-3 в натурных исследованиях не установлена статистическая значимость различий (p ≥ 0,05), однако этот белок включен в анализ и использован для прогнозирования негативных эффектов. Каковы критерии отбора белков для биоинформационного анализа в случаях, когда различия не значимы, и проводился ли дополнительный анализ (для коррекции множественных сравнений) для подтверждения его релевантности?
2. Учитывая, что изменения в выявленных белках (например, линкерном белке 4 с CAP-Gly) ассоциированы с когнитивными нарушениями и изменениями в печени на основе баз данных, планируются ли дальнейшие эксперименты для подтверждения этих механизмов (например, функциональные тесты на моделях или измерение маркеров окислительного стресса)? Как эти прогнозы могут быть интегрированы в практические стратегии профилактики для детей в зонах экологического риска?
Добрый день, Инга Николаевна! Спасибо за проявленный интерес к работе. 1. Действительно, для белка сидерофлексин-3 в натурных исследованиях не установлена статистическая значимость различий, однако они установлены в экспериментальных исследованиях. В реальных условиях на детей воздействует множество факторов одновременно, а в эксперименте можно моделировать реальные условия с исключением мешающих факторов. Нарушение синтеза сидерофлексина-3 именно в эксперименте указывает на то, что данный белок можно использовать для прогнозирования негативных эффектов. 2. Дальнейшие исследования, для подтверждения механизмов нарушений, не планируется, так как стояла задача найти изменения именно на клеточно-молекулярном уровне. Однако можно исследовать патогенетические механизмы изменениями лабораторных показателей (биохимических, иммунологических и др.), а также выявить изменения на органном уровне с помощью гистологического исследования у экспериментальных животных. Полученные результаты исследования используются для прогноза развития негативных эффектов у детей, в последующих возрастных периодах, при сохраняющихся условиях аэрогенной экспозиции изучаемыми химическими веществами.
Глубокоуважаемая Екатерина Владимировна! Уточните, пожалуйста, согласно какому критерию формировались выборки при выполнении натурных исследований: проживание в зоне экспозиции или уровень контаминации биологических сред изучаемыми факторами? Спасибо!
Добрый день, Олег Владимирович! Спасибо за интересный вопрос! Критерием формирования выборок детей группы наблюдения является повышенное содержание хрома и меди в крови относительно их референтных уровней, группы сравнения – содержание контаминантов на уровне референтных значений.